Le capitaine de pêche exerce des fonctions de direction (commandement) sur tous les types de navires. Il commande le plus souvent les grands navires armés pour la grande pêche qui quittent pendant plus de 20 jours leur port d'attache ou d'avitaillement.

Parfois les bancs de poissons sont repérés par avion ou par satellite, certains navires disposent d'équipements spécifiques (hélicoptères ...) pour les localiser. Commander ces navires, qui sont souvent d'authentiques usines flottantes, est un travail de haute technicité.